대다나다

[본문스크랩] SNP 의 종류 조그만 공간 | 키위새 http://melonheads.blog.me/90135560922 SNP의 종류 DNA는 A, T, G, C라고 쓰는 4가지 염기로 구성하고 있으며, 인간의 경우 약 30억 쌍에 달하는 염기가 무질서하게 반복된 모습을 하고 있습니다. 무질서해 보이지만 DNA의 특정 부분들은 각각의 의미 있는 배열을 가지고 있고, 이것이 유전자(gene)입니다. 인간은 약 3만개의 유전자를 가지고 있는 것으로 알려져 있습니다. DNA에서 유전되는 돌연변이와 다형성은 여러 종류가 있는데, SNP, CNP, Indel 등이 있습니다. CNP는 반복수 다형성(copy number polymorphism)으로 약 200개 염기 이상의 큰 영역의 반복횟수 차이로 구성됩니다. ..

제곱합(sum of squares, 자승합)은 표본 내의 각 사례의 변인 값과 평균 사이의 편차를 제곱한 값들의 총합으로, 표본 내의 변산성(개인차)의 총량을 나타내는 수치이다. 제곱합은 0보다 크거나 같다. 표본 내 모든 사례의 Y값이 같다면 제곱합이 0이다. 제곱합이 0이라면 표본 내 모든 사례의 Y값이 같다.

Wright's(1951) F-statistics 각 집단별 유전적고정에 따른 근친도와 집단간의 차별성 여부확인 Fit: 전체 품종집단에 대한 유전적 고정 정도 Fis: 품종집단별 유전적 고정 정도 Fst: 서로다른 품종집단간의 유전적 유사도 또는 차별화 정도 - 낮을수록 차별화 정도가 낮음 - 낮을수록 집단간 유사하다는 뜻

기대 이형접합도 (expected heterozygosity, Hexp)와 관측 이형접합도 (Observed heterozygosity, Hobs) 기대 이형접합도 (expected heterozygosity, Hexp): 대상 집단이 유전적 평형상태(Hardy-Weinberg equilibrium, HWE)에 있을 때 기대되는 각 개체식별 마커의 이형접합도를 계산 관측 이형접합도 (Observed heterozygosity, Hobs): 대상집단에 대한 각 개체식별 마커의 실제 이형접합도 ※ 이형접합도(hetero형, 이형률)가 낮으면 순종확률이 높다는 뜻 ※ 하디-바인베르크 평형(Hardy-Weinberg equilibrium) 또는 하디-와인버그 평형이란 대를 거듭하더라도 유전자 풀에서 대립 유전자..

PIC (polymorphic information content) 값 유전자 좌위의 다형성 정보량 자손의 유전자좌에 있어서, 한쪽 부모로 부터 2개의 대립유전자의 어느쪽을 이어 받았는가를 결론 지을 수 있는 확률 항상이형접합도 보다 작은 값을 가진다. 이것은 양부모가 같은 이형접합체일 때, 자손이 이형접합체이면 태아의 대립유전자의 유래가 결정되지 않는것에 기인한다. 따라서, 하나의 유전자좌의 대립유전자의 수가 많아질 수록 PIC값과 이형접합도는 유사한 값을 가지게 된다. 각 마커 별로 유전적 다형성 정도를 나타내주는 값값이 높을수록 다형성이 높다개체식별마커 선정시 사용

전기충격유전자전달법 (electroporation)법: 형질도입 방법중에 하나전기천공적격(electrocompetent): 전기반응성이 좋은 상태

Validation이란? "검증" 예를 들어 의약품의경우 "의도한 목표를 달성할 수 있는지 그 유효성을 확인하는 과정"을 밸리데이션이라고 한다고 한다.밸리데이션은 크게 적격성평가와 밸리데이션으로구분할 수 있다 "...특정의 공정, 이와 관련된 System 등이 미리 설정한 판정 기준(GMP 기준)에 맞게 적합하게 동작되고 실행되는지를 확인하고 이를 문서화 하여 검증하는 것 [출처] Validation 이란?|작성자 ksbpori

1종오류(TYPE 1 ERROR)와 2종 오류(TYPE 2 ERROR) 1종 오류( TYPE 1 ERROR): 실제 상황은 귀무가설이 사실이나 귀무가설을 기각해버리는 오류2종 오류(TYPE 2 ERROR): 실제 상황은 귀무가설이 거짓이나 귀무가설을 기각하지않는 오류 효과가 없는대도 효과가 있다라고 잘못해석을 하게되는 1종오류의 경우 심각한 결과를 만들 수 있다.

정확성(accuracy)과 정밀성(precision) 정확성(accuracy): 측정값이 실제 값과 얼마나 가까운지를 나타냄 (closeness of a measured value to the true value) 정밀성(precision): 같은 값을 반복적으로 측정했을 때의 반복된 측정값에 대한 분산성을 나타냄 (spread” or variability of repeated measures of the same value) 실험에서 결과해석의 오류는 정확성과 정밀성 모두 떨어질때가 아니라 정밀성은 높으나 정확성이 떨어지는 결과를 얻었을때다.

유의확률(P-value)란 쉽게 말해서 귀무가설이 참일 확률을 말한다. P-value